登録済み教団リスト（50音順）
- アメン教団
- イエス・キリスト福音の群
- イムマヌエル綜合伝道団
- ウェスレアン・ホーリネス教会連合
- 栄光の福音キリスト教団
- エバンゼリカル・コングリゲーショナル・チャーチ
- 沖縄キリスト福音センター
- 沖縄バプテスト連盟
- 科学者キリスト教会
- カルバリー・バプテスト教会
- カルバリーチャペルグループ
- カンバーランド長老教会
- 九州キリスト福音フェローシップ
- 救世軍
- キリスト教会同盟
- 基督兄弟団
- キリスト教日本バプテスト会（連盟）
- キリスト教横浜福音教会
- キリスト公同教会
- キリスト信徒の集会
- 基督聖協団
- キリスト伝道団
- キリスト同信会
- キリストの教会（チャーチ・オブ・クライスト系）
- キリストの教会（クリスチャン・チャーチ系）
- キリスト友会日本年会
- 近畿福音ルーテル教会
- クリスチャンズ・イン・アクション宣教団
- クリスチャンインターナショナルアジア
- クリスチャン・ライフ・チャーチズ・インターナショナル
- 国際宣教師団
- 国際福音キリスト教団
- 国際福音宣教会
- 国際福音連盟
- 在日スウェーデン基督教同盟宣教師団
- 在日大韓基督教会総会
- サンビ教団
- シオン・キリスト教団
- 使徒の信仰伝道団
- 地元にあって合一である立場に立つ教会
- 真イエス教会日本総会
- 聖イエス教会
- 聖書キリスト教会
- 聖書友の会
- セブンスデー・アドベンチスト教団
- センド国際宣教団
- 単立（一部）
- チャーチ・オブ・ゴッド
- 東京地区メノナイト教会連合
- 東京フリー・メソジスト教会
- 東京ホライズン・チャペル
- 同盟福音基督教会
- 東洋宣教会きよめ教会
- 西日本福音ルーテル教会
- 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団
- 日本アライアンス教団
- 日本アライアンス・ミッション
- 日本イエス・キリスト教団
- 日本基督会
- 日本キリスト改革長老教会
- 日本基督改革派教会
- 日本キリスト教会
- 日本基督教団
- 日本キリスト兄弟団
- 日本キリスト合同教会
- 日本キリスト宣教団
- 日本キリストの教会
- 日本国際宣教団体
- 日本自由メソヂスト教団
- 日本新使徒教会
- 日本聖契キリスト教団
- 日本聖公会（一部）
- 日本聖泉基督教会連合
- 日本聖約キリスト教団
- 日本宣教会
- 日本チャーチ・オブ・ゴッド教団
- 日本長老教会
- 日本伝道隊
- 日本伝道福音教団
- 日本同盟基督教団
- 日本ナザレン教団
- 日本バイブル・プロテスタント・基督教会
- 日本バプテスト教会連合
- 日本バプテスト宣教団
- 日本バプテスト同盟
- 日本バプテスト・バイブル・フェローシップ
- 日本バプテスト連合
- 日本バプテスト連盟
- 日本フォースクェア福音教団
- 日本福音改革派教会
- 日本福音教会連合
- 日本福音教団
- 日本福音キリスト教会連合
- 日本福音交友ミッション
- 日本福音自由教会協議会
- 日本福音ルーテル教会
- 日本フリーメソジスト教団
- 日本ベテル・ミッション
- 日本ペンテコステ神之教会教団
- 日本ホーリネス教団
- 日本メノナイト・ブレザレン教団
- 日本リバイバル連盟
- 日本ルーテル教団
- 日本ルーテル同胞教団
- ノルウェージャン・ミッショナリー・アライアンス教団
- フェローシップ・ディコンリー福音教団
- 福音伝道教団
- 福音バプテスト宣教団
- 福音バプテスト連合
- 復元イエス・キリスト教会
- 保守バプテスト同盟
- 恵みの森キリスト教会
- リーベンゼラ日本宣教団
- ルーテル福音キリスト教会
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